南京灵谷寺位于南京市玄武区紫金山东南坡下，中山陵以东约1.5千米处，始建于天监十三年（514年），是南朝梁武帝为纪念著名僧人宝志禅师而兴建的“开善精舍”，初名开善寺。明朝时朱元璋亲自赐名“灵谷禅寺”，并封其为“天下第一禅林”，为明代佛教三大寺院之一。《金陵梵刹志》将其与大报恩寺、天界寺并列为大刹。

南京灵谷寺内有放生池、金刚殿、天王殿、无量殿（又称无梁殿）、五方殿、毗卢殿、观音阁等殿堂，寺后有宝公塔。灵谷寺玄奘纪念堂中供奉玄奘法师坐像，像前的玄奘法师顶骨纪念塔中有玄奘顶骨舍利。

1983年，南京灵谷寺被定为汉族地区佛教全国重点寺院。2006年，国务院将国民革命军阵亡将士公墓、中山陵附属谭延闿墓、邓演达墓列为全国重点文物保护单位。